Podobne ako štátne varovné systémy sú aj mestské budované proti tzv. všeobecnému ohrozeniu, aj keď vzhľadom k menšiemu územiu a miestnym podmienkam je často niektorý typ ohrozenia dominantný. Vzťah medzi celoštátnym a mestským varovným systémom je závislý od legislatívy konkrétneho štátu. V niektorých krajinách existuje iba štátny varovný systém, v niektorých iba mestské systémy. Často centrálna vláda stanovuje iba technické podmienky pre mestské systémy a spôsob ich centrálneho ovládania a za ich vybudovanie a prevádzku je zodpovedná miestna samospráva.

Varovný systém je v tomto prípade štandardne ovládaný z jedného Varovného a vyrozumievacieho centra, ktorého technológia je 100% zálohovaná. V prípade väčších miest je možné ovládanie aj z mestských častí. Sirény sú ovládané prostredníctvom rádiovej infraštruktúry pracujúcej na vyhradených rádiových kanáloch. Ako záložný kanál sa používa POCSAG, GPRS prípadne ovládanie cez satelit. Ovládanie cez satelit môže byť aj hlavným ovládacím kanálom. Systém aktivuje sirény v priebehu niekoľkých sekúnd a v priebehu niekoľkých minút poskytne spätnú informáciu o tom, s akým výsledkom prebehla aktivácia jednotlivých sirén. Je možné ovládať ako sirény vlastné, tak sirény tzv. autonómnych varovných systémov, prevádzkovaných priemyselnými ohrozovateľmi. Ďalej je možné ovládať evakuačné rozhlasy vo vnútri budov, rozhlasy na športoviskách a mestské rozhlasy ak existujú. Varovné a vyrozumievacie centrum je vybavené softvérom VEKTRA umožňujúcim okrem monitorovania a ovládania siete sirén aj účinnú podporu procesov prebiehajúcich vo Varovnom centre po vyhlásení mimoriadnej situácie. Ide predovšetkým o automatické zvolávanie kompetentných pracovníkov na pracovisko a informovanie príslušných inštitúcii podľa krízových plánov. Systém je tvorený:

• hlavným mestským Varovným a vyrozumievacím centrom,
• Varovnými a vyrozumievacími centrami mestských častí (vo väčších mestách),
• rádiovou komunikačnou infraštruktúrou (v prípade menších miest postačia rádiomodemy v sirénach), 
• elektronickými sirénami typu PAVIAN, 
• rozhraniami pre autonómne varovné systémy a rozhlasy.
  

Hlavné mestské Varovné a vyrozumievacie centrum
Je tvorené počítačom so softvérom VEKTRA, centrálnou komunikačnou jednotkou pre rádiové ovládanie sirén a ďalším hardvérom pre záložný komunikačný kanál, vyrozumievanie a záznam komunikácie. Celá technológia je 100% zálohovaná a je z nej možné ovládať všetky sirény v meste, pripojené autonómne systémy a rozhlasy. Softvér VEKTRA zaisťuje permanentnú kontrolu stavu jednotlivých sirén a stavu komunikačného kanálu. Po vyhlásení mimoriadnej situácie zaisťuje účinnú podporu procesov prebiehajúcich v centre, predovšetkým vyrozumenie kompetentných osôb a inštitúcii a záznam telefónnej a rádiovej komunikácie pre účely neskoršej analýzy.  

Varovné a vyrozumievacie centrá mestských častí
Môžu byť taktiež vybavené počítačom so softvérom VEKTRA a umožňovať rovnakú funkčnosť ako Hlavné centrum, alebo iba modulom lokálneho ovládania LCU umožňujúcim aktiváciu sirén v príslušnej mestskej časti, v závislosti od jej kompetencii a veľkosti.

Komunikačná infraštruktúra
Ako hlavný komunikačný kanál sa používa vyhradený rádiový kanál, je však možné použiť aj satelitné ovládanie, alebo štandard WiFi. Pre vyhradený rádiový kanál často postačujú iba rádiomodemy v sirénach, ktoré sú ich štandardným rozširujúcim modulom a zároveň umožňujú, aby každá siréna mohla byť použitá ako retranslačná stanica, čo podstatne znižuje náklady na vybudovanie infraštruktúry. V prípade väčších miest a členitejšieho terénu je možné použiť samostatné retranslačné stanice alebo komunikačné jednotky SMART. Použitie technológie WiFi vyžaduje vybudovanie samostatnej komunikačnej infraštruktúry vzhľadom na obmedzený dosah vysielačov. Použitie satelitnej komunikácie je veľmi jednoduché, pretože znamená iba použiť satelitný dátový modem od príslušného poskytovateľa tejto služby v každej siréne, zatiaľ sú však prevádzkové náklady pomerne vysoké. Záložný ovládací kanál sa použije v závislosti od miestnych podmienok a typu hlavného kanála, s ktorým by nemal zdieľať žiadny spoločný prvok.  

Rozhrania pre autonómne systémy a rozhlasy
Vo väčšine štátov je už povinnosť budovania požiarnych evakuačných rozhlasov v budovách zakotvená priamo v legislatíve. Niekde je v legislatíve zakotvená aj povinnosť prepojiť tieto rozhlasy so štátnym alebo mestským varovným systémom, ktorých účelom je ozvučiť predovšetkým vonkajšie priestory. Vzhľadom k charakteru života v mestách a zvukovo izolačným vlastnostiam nových budov je možné prepojením evakuačných rozhlasov a mestských varovných systémov podstatným spôsobom zvýšiť účinnosť varovania. Taktiež pripojenie autonómnych varovných systémov budovaných priemyselnými ohrozovateľmi zvyšuje účinnosť varovania. Pre pripojenie týchto systémov je použitá prepojovacia jednotka TSTG.